MongoDB: 100.000 Genome Project

von Marc-David Militz Forum: Neuigkeiten

Das, vom britischen Gesundheitsministerium durchgeführte, 100.000 Genome Project sequenziert die gesamten Genome von 100.000 Patienten mit seltenen Krankheiten, sowie die Genome ihrer Familienmitglieder. Das Projekt ist derzeit bei der Hälfte angekommen und soll bis Ende 2018 abgeschlossen sein.

Die daraus resultierenden Daten, ca. 20 Petabyte, werden in einer MongoDB gespeichert. MongoDB zufolge ist die Menge der verarbeiteten Daten gigantisch. Pro Woche werden ca. 1.000 Genome sequenziert, wobei etwa 10 GB an Daten entstehen. Datei kommt MongoDB Advanced zu Einsatz.

Laut Augusto Rendon, dem Leiter des Projektes, hat man sich für MongoDB entschieden da hier die Datenhaltung und -analyse auf einer Plattform betrieben werden kann.

https://www.genomicsengland.co.uk/the-100000-genomes-project/